Personenverkeer wordt waar mogelijk omgeleid via de pas, terwijl zware vrachtwagens (>3,5 ton) 30 minuten voor de afsluiting van de tunnel bij de noord- en zuidingangen worden tegengehouden.

Elk jaar wordt de Gotthardtunnel in maart/april (1 week), juni (2 weken) en september/oktober (3-4 weken) voor 26 nachten afgesloten.

De nachtelijke afsluitingen zijn voornamelijk bedoeld voor werkzaamheden in de verkeersruimte: het reinigen van tunnelwanden, verlichtingssystemen, SOS-nissen, ventilatiekanalen en andere faciliteiten. Waar nodig worden kleine structurele reparaties uitgevoerd, en er wordt ook onderhoudswerk aan operationele en veiligheidssystemen uitgevoerd, waarbij de toestand van deze apparatuur wordt beoordeeld.