Il traffico passeggeri sarà deviato attraverso il passo, se possibile, mentre i mezzi pesanti (>3,5 tonnellate) saranno fermati 30 minuti prima della chiusura del tunnel sia a nord che a sud.

Ogni anno la galleria del Gottardo viene chiusa a marzo/aprile (1 settimana), giugno (2 settimane) e settembre/ottobre (3-4 settimane) per 26 notti. Fino ad ottobre è quindi prevista la chiusura del tunnel al traffico nelle notti da lunedì a venerdì, tra le ore 20:00 e le 5:00.

Le chiusure notturne sono finalizzate principalmente all'esecuzione di lavori nello spazio di circolazione: pulizia di pareti della galleria, sistemi di illuminazione, nicchie SOS, canali di ventilazione e altri impianti. Dove necessario si eseguono riparazioni strutturali minori; inoltre vengono effettuati interventi di manutenzione dell'impiantistica di esercizio e sicurezza, durante i quali si rileva anche lo stato di tali apparecchiature.